为加强党的组织建设，充分发挥基层党组织在社会组织中的战斗堡垒作用和党员先锋模范作用，协会于2022年7月1日成立党支部，隶属于中关村军民融合创新创业基地企业联合党总支，现任党支部书记为协会常务副秘书长田磊。

协会党组织成立以来，深入学习贯彻党的二十大精神，坚持把党建工作与协会工作同步谋划、同步部署、同步推进。将党建工作与协会工作高度融合，以党建促会建，以党建促业务，以党建促发展，把协会成员紧紧团结在党组织周围，切实发挥党建合力、凝聚人心的作用，促进协会与会员共发展。

协会党支部设有党群活动中心，包括党建宣传及军民融合数据展播厅、党建会议室、多功能党建活动厅、图书室、党建墙等。活动中心多次开展军民融合成果交流、大型党课、访谈演播、对外宣传、读书沙龙等活动，成为多功能为一体的党建活动阵地。